Ce terme a des concepts différents, chacun dépendra de la spécialité scientifique où il est appliqué. Par exemple, en biologie, l' épigénèse est une vieille théorie sur le mécanisme par lequel l'être humain se développe, c'est-à-dire qu'un embryon évolue à partir du zygote qui n'a pas encore été distingué, ce qui montre l'inexistence d'éléments miniatures, d'organes qui sont déjà présents dans les gamètes.
Cette théorie contredit la théorie de la préformation, qui déclare que l' évolution d'un embryon représente la croissance d'un organisme déjà préformé. Cependant , selon l'épigénèse, les organes qui composent l'embryon sont formés à partir de rien, grâce à des stimuli dérivés de l'environnement.
Cette théorie interprète le mécanisme d'accord final, au moyen duquel chaque être est couplé, de manière efficace à son environnement, à partir des capacités incluses dans son codage génétique. Étant donné que les gènes font généralement partie d'un réseau d'interactions quelque peu compliqué qui maintient la rétroaction. Et par conséquent, ils ne procèdent pas indépendamment.
Tout au long de l' histoire, il y a toujours eu un débat qui confronte la théorie épigénétique à la préformation. Cependant, le préformationnisme prend fin, au même moment où la technologie pourrait démontrer l'origine épigénétique des organes. Il faut ajouter que ce débat a été l'un des plus historiques jamais vus, il s'est tenu au XIXe siècle.
Or, dans le domaine de la minéralogie, le terme épigénèse est utilisé pour désigner la modification de la nature chimique d'un minéral, sans qu'il soit nécessaire de modifier sa structure.